Depuis sa fondation en 1878 et surtout depuis son arrivée sur le campus universitaire en 1967, la FTSR constitue un pôle majeur de la théologie francophone en Amérique du Nord. Elle contribue au GREB (Groupe de recherche en bioéthique) depuis 1977, au CERUM (Centre d’étude des religions de l’Université de Montréal) depuis 2000, au CETECQ (Centre d’éthique et de théologie contextuelles québécoises) depuis 2004 et elle s’est associée au CINR (Centre d’informations sur les nouvelles religions) en 2005. Par ses partenariats, elle entend apporter sa contribution au rapprochement entre le savoir et les engagements personnels, y compris religieux.
